南奥克尼群岛的气候通常是风、湿、冷。 夏季从12月持续到3月,参加南奥克尼群岛考察航行的个人平均气温预计为3.5摄氏度(华氏38.3度 ) 。

4月底至11月,南奥尔克尼群岛大部分无法进入,原因是附近水在这一期间被冰覆盖,7月的平均冬季温度降至 - 12.8摄氏度(9华氏度)。